Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDGFDQ9GZP0 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.4 ms