Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
LINC00612Q8N6U2 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LINC00612Q8N6U2 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms