Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NLRC3Q7RTR2 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NLRC3Q7RTR2 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NLRC3Q7RTR2 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NLRC3Q7RTR2 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NLRC3Q7RTR2 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NLRC3Q7RTR2 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NLRC3Q7RTR2 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NLRC3Q7RTR2 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NLRC3Q7RTR2 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NLRC3Q7RTR2 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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