Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTXN3Q4LDR2 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTXN3Q4LDR2 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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