| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA75.2-201 | ENST00000391138 | 150 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA75.3-201 | ENST00000391231 | 150 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU4-43P-201 | ENST00000410628 | 137 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-938P-201 | ENST00000411285 | 103 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL591704.2-201 | ENST00000421658 | 181 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AF228730.3-201 | ENST00000436691 | 102 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD36C-201 | ENST00000516733 | 66 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-388P-201 | ENST00000517012 | 105 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-389P-201 | ENST00000517048 | 105 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC090821.2-201 | ENST00000523552 | 176 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC130289.1-201 | ENST00000577321 | 73 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Z83818.1-201 | ENST00000603584 | 150 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD115-40-201 | ENST00000606510 | 82 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZFAT-AS1_2.1-201 | ENST00000613742 | 201 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC078938.1-201 | ENST00000620993 | 318 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF732-201 | ENST00000419098 | 2193 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.330-201 | ENST00000365230 | 109 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA40.5-201 | ENST00000391061 | 128 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR1185-1-201 | ENST00000408598 | 86 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU7-67P-201 | ENST00000459003 | 62 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS26P48-201 | ENST00000491713 | 339 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU2-13P-201 | ENST00000515909 | 113 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP404-201 | ENST00000517118 | 132 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP003716.2-201 | ENST00000528260 | 108 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC141273.2-201 | ENST00000618989 | 130 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND1P7-201 | ENST00000632801 | 297 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LRRIQ1-202 | ENST00000393217 | 5394 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1020P-201 | ENST00000363684 | 107 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU1-124P-201 | ENST00000363861 | 145 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.224-201 | ENST00000364308 | 111 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-47P-201 | ENST00000383866 | 107 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA1-201 | ENST00000384107 | 130 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.552-201 | ENST00000384665 | 112 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TRAJ2-201 | ENST00000390535 | 66 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-918P-201 | ENST00000391219 | 106 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC063976.4-201 | ENST00000421971 | 163 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA18.4-201 | ENST00000516440 | 124 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP000942.4-201 | ENST00000604811 | 241 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR7974-201 | ENST00000615835 | 79 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | KIAA1551-201 | ENST00000312561 | 6230 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC008163.1-202 | ENST00000636004 | 2889 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.191-201 | ENST00000363972 | 113 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.274-201 | ENST00000364714 | 101 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA27-201 | ENST00000384323 | 126 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU7-21P-201 | ENST00000459430 | 62 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-958P-201 | ENST00000516995 | 106 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | IGLVVI-22-1-201 | ENST00000521183 | 211 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR548AO-201 | ENST00000579992 | 96 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR4295-201 | ENST00000585286 | 85 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP003174.1-201 | ENST00000306533 | 376 nt | TSL 2 BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR96-201 | ENST00000362288 | 78 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD114-27-201 | ENST00000363766 | 70 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-275P-201 | ENST00000364910 | 107 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1189P-201 | ENST00000383958 | 107 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.410-201 | ENST00000383992 | 113 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.412-201 | ENST00000384001 | 104 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6ATAC23P-201 | ENST00000408448 | 123 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC002429.1-201 | ENST00000437672 | 148 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL353614.1-201 | ENST00000445631 | 206 nt | TSL 5 BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU7-90P-201 | ENST00000459216 | 62 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC087343.1-201 | ENST00000477341 | 475 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS23P4-201 | ENST00000487908 | 423 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC090155.2-201 | ENST00000518854 | 267 nt | TSL 3 BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR3129-201 | ENST00000581095 | 76 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR4452-201 | ENST00000583004 | 71 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SEPT14P17-201 | ENST00000617978 | 177 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | U6.106-201 | ENST00000636360 | 105 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.297-201 | ENST00000364950 | 91 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD114-22-201 | ENST00000365423 | 72 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-643P-201 | ENST00000384018 | 107 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR19B1-201 | ENST00000384829 | 87 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD77.3-201 | ENST00000391113 | 65 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR1302-7-201 | ENST00000408841 | 72 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL392103.1-201 | ENST00000447000 | 198 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC111194.2-201 | ENST00000511222 | 455 nt | TSL 5 BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD116-25-201 | ENST00000516517 | 92 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU11-2P-201 | ENST00000516898 | 142 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR378D2-201 | ENST00000580636 | 98 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CEP290-201 | ENST00000309041 | 7616 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.75-201 | ENST00000362927 | 97 nt | BASIC | 1.19 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.435-201 | ENST00000384095 | 112 nt | BASIC | 1.19 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA24-201 | ENST00000384096 | 131 nt | BASIC | 1.19 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL135790.1-201 | ENST00000427161 | 157 nt | TSL 3 BASIC | 1.19 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | snoU13.16-201 | ENST00000459350 | 104 nt | BASIC | 1.19 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS29P24-201 | ENST00000486345 | 171 nt | BASIC | 1.19 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.542-201 | ENST00000384641 | 111 nt | BASIC | 1.18 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC006461.1-201 | ENST00000412637 | 326 nt | BASIC | 1.18 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MRPL35P3-201 | ENST00000421557 | 364 nt | BASIC | 1.18 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL138752.1-201 | ENST00000452964 | 351 nt | BASIC | 1.18 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.644-201 | ENST00000459006 | 113 nt | BASIC | 1.18 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.674-201 | ENST00000516362 | 113 nt | BASIC | 1.18 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HIF1A-204 | ENST00000539097 | 3956 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.116-201 | ENST00000363292 | 103 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-396P-201 | ENST00000365369 | 105 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU7-53P-201 | ENST00000516705 | 60 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC022559.1-201 | ENST00000520905 | 205 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MRPS18CP4-201 | ENST00000535821 | 231 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PNRC2-204 | ENST00000579103 | 171 nt | TSL 2 BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR6516-201 | ENST00000630554 | 81 nt | BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DENND4A-209 | ENST00000635620 | 5887 nt | TSL 5 BASIC | 1.17 | □□□□□ -2.22 | | |