Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
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