Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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PTPRNQ16849 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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PTPRNQ16849 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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PTPRNQ16849 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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PTPRNQ16849 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRNQ16849 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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PTPRNQ16849 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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PTPRNQ16849 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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PTPRNQ16849 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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PTPRNQ16849 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRNQ16849 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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