Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPROQ16827 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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