Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NTRK3Q16288 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NTRK3Q16288 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.6 ms