Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
E2F4Q16254 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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