| CHRNA2 | Q15822 | Y_RNA.35-201 | ENST00000362601 | 101 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU6-153P-201 | ENST00000364422 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU1-40P-201 | ENST00000516816 | 164 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU1-97P-201 | ENST00000516872 | 164 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU7-181P-201 | ENST00000517234 | 74 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AC121758.2-201 | ENST00000553271 | 193 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIR4778-201 | ENST00000577635 | 80 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AL137067.1-201 | ENST00000615933 | 120 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AC027279.3-201 | ENST00000625055 | 122 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | WWP1P1-201 | ENST00000466609 | 2769 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU6-690P-201 | ENST00000365242 | 106 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | Y_RNA.351-201 | ENST00000365436 | 96 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | SNORA22-201 | ENST00000383907 | 134 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | Y_RNA.494-201 | ENST00000384432 | 111 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | SNORD116-21-201 | ENST00000384507 | 92 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | Y_RNA.528-201 | ENST00000384575 | 108 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU6-950P-201 | ENST00000384651 | 107 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | Y_RNA.649-201 | ENST00000459077 | 103 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | PDCD5P2-201 | ENST00000507570 | 312 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU6-589P-201 | ENST00000516485 | 107 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU7-70P-201 | ENST00000516941 | 66 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIR4709-201 | ENST00000577272 | 72 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIR4529-201 | ENST00000578110 | 78 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | HSPE1P19-201 | ENST00000603327 | 295 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AL596211.1-201 | ENST00000569873 | 2277 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | KTN1-207 | ENST00000438792 | 4449 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | Y_RNA.241-201 | ENST00000364470 | 117 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | Y_RNA.346-201 | ENST00000365385 | 112 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIR144-201 | ENST00000384886 | 86 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | snoU13.18-201 | ENST00000459483 | 104 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | NMTRQ-TTG12-1-201 | ENST00000467595 | 72 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | HMSD-204 | ENST00000526932 | 162 nt | TSL 3 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIR4419B-201 | ENST00000577260 | 68 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | SNORA4-201 | ENST00000584302 | 138 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | LINC01790-201 | ENST00000447194 | 2852 nt | TSL 2 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | TAB2-205 | ENST00000538427 | 4240 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU6-833P-201 | ENST00000363486 | 107 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU4-16P-201 | ENST00000364737 | 141 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU1-133P-201 | ENST00000364867 | 167 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU6-392P-201 | ENST00000364926 | 101 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | ZNF468-202 | ENST00000396409 | 384 nt | TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNA5SP100-201 | ENST00000410903 | 110 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNA5SP59-201 | ENST00000410922 | 110 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AC092783.1-201 | ENST00000435832 | 231 nt | TSL 3 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | snoU13.27-201 | ENST00000459278 | 104 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AC099513.1-201 | ENST00000490423 | 301 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | 5S_rRNA.3-201 | ENST00000517021 | 110 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | 5S_rRNA.19-201 | ENST00000612131 | 110 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | U1.36-201 | ENST00000620684 | 176 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | 5S_rRNA.18-201 | ENST00000621941 | 110 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AC091932.4-201 | ENST00000623386 | 200 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | LMBR1-222 | ENST00000638959 | 93 nt | TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AP000553.5-201 | ENST00000641933 | 54 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | KIAA1107-201 | ENST00000370378 | 4622 nt | TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU6-349P-201 | ENST00000362402 | 107 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AC087499.4-201 | ENST00000448505 | 178 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU6-113P-201 | ENST00000516653 | 101 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | SNORA31.17-201 | ENST00000516953 | 127 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU6-60P-201 | ENST00000364792 | 103 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | SNORD23.1-201 | ENST00000408212 | 104 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RPS26P48-201 | ENST00000491713 | 339 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNY4P20-201 | ENST00000516678 | 93 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AC090821.2-201 | ENST00000523552 | 176 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIR6504-201 | ENST00000613520 | 61 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | UGP2-230 | ENST00000626380 | 276 nt | TSL 5 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | FSD1L-201 | ENST00000374707 | 7062 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | PTPRQ-208 | ENST00000614701 | 8289 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNA5SP276-201 | ENST00000362580 | 94 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | SNORA6-201 | ENST00000384033 | 151 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNY1P6-201 | ENST00000384193 | 109 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | SNORA27-201 | ENST00000384323 | 126 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIR526A1-201 | ENST00000384897 | 85 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AC009474.2-201 | ENST00000451383 | 136 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AC021443.1-201 | ENST00000604478 | 211 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | GNAS-AS1_4.1-201 | ENST00000616546 | 112 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | SNORD3E-202 | ENST00000627253 | 216 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | U8.17-201 | ENST00000391292 | 132 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIR1267-201 | ENST00000408723 | 78 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AC063976.4-201 | ENST00000421971 | 163 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | PGBD4P5-201 | ENST00000445958 | 426 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AC079760.1-201 | ENST00000456952 | 202 nt | TSL 3 BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNA5SP57-201 | ENST00000459463 | 123 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU2-19P-201 | ENST00000517288 | 84 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | SNORD53B-201 | ENST00000577887 | 78 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AP000648.3-201 | ENST00000623539 | 4507 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIER3-204 | ENST00000381226 | 5210 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | CALCRL-201 | ENST00000392370 | 5155 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIR660-201 | ENST00000385235 | 97 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | AC055731.1-201 | ENST00000474387 | 401 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | SNORA31.4-201 | ENST00000516049 | 129 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU6-830P-201 | ENST00000516353 | 107 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNA5SP481-201 | ENST00000516814 | 122 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIR5694-201 | ENST00000581190 | 76 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | DLEU2_5.2-201 | ENST00000610606 | 84 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | PCDH11Y-203 | ENST00000362095 | 4220 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU6-880P-201 | ENST00000384526 | 107 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIR570-201 | ENST00000384917 | 97 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIR452-201 | ENST00000385020 | 85 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | MIR1323-201 | ENST00000408090 | 73 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| CHRNA2 | Q15822 | RNU7-164P-201 | ENST00000459221 | 62 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |