Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCAPHQ15003 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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