Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NR1I3Q14994 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NR1I3Q14994 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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