Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
GPNMBQ14956 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
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GPNMBQ14956 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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GPNMBQ14956 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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GPNMBQ14956 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
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GPNMBQ14956 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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GPNMBQ14956 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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GPNMBQ14956 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GPNMBQ14956 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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