Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RBM39Q14498 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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