Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LSAMPQ13449 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
LSAMPQ13449 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
LSAMPQ13449 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms