Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATMQ13315 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATMQ13315 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATMQ13315 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATMQ13315 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATMQ13315 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATMQ13315 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATMQ13315 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATMQ13315 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATMQ13315 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATMQ13315 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
ATMQ13315 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
ATMQ13315 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
ATMQ13315 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATMQ13315 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATMQ13315 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATMQ13315 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATMQ13315 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATMQ13315 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATMQ13315 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATMQ13315 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATMQ13315 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATMQ13315 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATMQ13315 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATMQ13315 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATMQ13315 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
ATMQ13315 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
ATMQ13315 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
ATMQ13315 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms