Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERCC8Q13216 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms