Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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TRAF1Q13077 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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TRAF1Q13077 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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TRAF1Q13077 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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TRAF1Q13077 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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TRAF1Q13077 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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TRAF1Q13077 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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TRAF1Q13077 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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TRAF1Q13077 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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TRAF1Q13077 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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TRAF1Q13077 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TRAF1Q13077 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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TRAF1Q13077 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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