Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CSTF3Q12996 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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