Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
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PTPN13Q12923 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
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PTPN13Q12923 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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