Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RBBP4Q09028 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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RBBP4Q09028 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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RBBP4Q09028 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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RBBP4Q09028 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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RBBP4Q09028 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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RBBP4Q09028 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
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RBBP4Q09028 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RBBP4Q09028 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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