Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms