Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
CASQ1P31415 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CASQ1P31415 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CASQ1P31415 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CASQ1P31415 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CASQ1P31415 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CASQ1P31415 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CASQ1P31415 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CASQ1P31415 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CASQ1P31415 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CASQ1P31415 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CASQ1P31415 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CASQ1P31415 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CASQ1P31415 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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CASQ1P31415 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
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CASQ1P31415 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.85□□□□□ -2.54
CASQ1P31415 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CASQ1P31415 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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