Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTIFO43310 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTIFO43310 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTIFO43310 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTIFO43310 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTIFO43310 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTIFO43310 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTIFO43310 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTIFO43310 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
CTIFO43310 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTIFO43310 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTIFO43310 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CTIFO43310 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CTIFO43310 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CTIFO43310 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTIFO43310 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTIFO43310 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTIFO43310 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTIFO43310 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CTIFO43310 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTIFO43310 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTIFO43310 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTIFO43310 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.3 ms