Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MEIS1O00470 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MEIS1O00470 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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