Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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