Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRQQ9UMZ3 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 345 ms