Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
EHD3Q9NZN3 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
EHD3Q9NZN3 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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