Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATG3Q9NT62 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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