Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPN21Q16825 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPN21Q16825 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms