Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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RTN1Q16799 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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RTN1Q16799 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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RTN1Q16799 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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RTN1Q16799 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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RTN1Q16799 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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RTN1Q16799 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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RTN1Q16799 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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RTN1Q16799 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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RTN1Q16799 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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