Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HERC1Q15751 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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