Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-2.2□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-2.2□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-2.22□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
HMGN3Q15651 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-2.27□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
HMGN3Q15651 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
HMGN3Q15651 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
HMGN3Q15651 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
HMGN3Q15651 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
HMGN3Q15651 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
HMGN3Q15651 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
HMGN3Q15651 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
HMGN3Q15651 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
HMGN3Q15651 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
HMGN3Q15651 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
HMGN3Q15651 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-2.3□□□□□ -2.78
HMGN3Q15651 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
HMGN3Q15651 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms