Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23AQ15436 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23AQ15436 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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