Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDCD1Q15116 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDCD1Q15116 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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