Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC3Q15034 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC3Q15034 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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