Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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CHD4Q14839 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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CHD4Q14839 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHD4Q14839 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHD4Q14839 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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