Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RFTN1Q14699 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms