Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAPRIN1Q14444 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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