Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
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PTCH1Q13635 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTCH1Q13635 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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