Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NEUROD1Q13562 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NEUROD1Q13562 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEUROD1Q13562 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEUROD1Q13562 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEUROD1Q13562 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEUROD1Q13562 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEUROD1Q13562 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEUROD1Q13562 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEUROD1Q13562 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEUROD1Q13562 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NEUROD1Q13562 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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