Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TCIRG1Q13488 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TCIRG1Q13488 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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