Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
TUSC3Q13454 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUSC3Q13454 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms