Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SF3B2Q13435 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SF3B2Q13435 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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