Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
KLF1Q13351 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KLF1Q13351 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF1Q13351 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF1Q13351 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF1Q13351 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF1Q13351 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KLF1Q13351 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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