Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SEMA3FQ13275 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SEMA3FQ13275 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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