Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms