Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP18Q9UMW8 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USP18Q9UMW8 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms