Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EDEM3Q9BZQ6 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EDEM3Q9BZQ6 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
EDEM3Q9BZQ6 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
EDEM3Q9BZQ6 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EDEM3Q9BZQ6 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EDEM3Q9BZQ6 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
EDEM3Q9BZQ6 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
EDEM3Q9BZQ6 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
EDEM3Q9BZQ6 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
EDEM3Q9BZQ6 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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