Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
SMG1Q96Q15 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
SMG1Q96Q15 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
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